創立年月は不詳。往古より高宮大明神と称した。

明治元年（1868）、高宮社と改称し、同7年、高宮神社と改称した。

境内鎮座の地主神社は古くから荒神宮と称し、当社の摂社として村内に祀られていたが、明治元年廃社となり、同12年あらためて当社境内に再興された。