勧請年月は不詳である。今在家村には往古から三宝荒神、八大荒神、天神の3社が奉祀されていた。

享保16年（1731）「奉創築天神社殿一宇成就」の棟札が現存する。

近世末に各社を合祭し、明治初年に境内末社稲荷神（保食神）を合祀して、社名を今在家神社と改めた。

学問の神様として学童、学生の参詣が多い。