創立年月不詳。近世は大将軍また大蛇郷宮（字名によって）と称した。

明治初年に上部中野村の荒神（素盞嗚尊）を合祀し、福佐陀神社と改称した。

昭和20年以前は旧境町宮ノ西鎮座旧餘子神社（戦災により焼失し大港神社に合祀）の摂社であった。福定町の氏神である。