創立年代不詳。『日本三代実録』貞観3年（861）10月の条 に「因幡国正六位上酒賀神授従五位下」、貞観16年（874）5月の条に「授因幡国須賀神従五位上」と記されている国史現在社である。

大草郷12ヶ村の総氏神として崇敬された。

元禄3年（1690）の小泉友賢書「因幡国正五位下酒賀神」の木簡が残っている。

文政9年（1826）野火により社殿を焼失したが、天保13年（1842）に再建したのが現在の社殿である。

明治初年に酒賀神社と改称。

平成13年、 殿ダム新設に伴い、拾石神社（も と瀧神罔象女命）と殿村神社（も と荒神須佐之男命）を合併した。 本殿には多種の彫刻が施され、酒の神にふさわしい「酒呑童子」 の彫刻が目を引く。

『因幡誌』は「平家滅亡後、二位尼が三種の神器を当社に依託。 宝暦年間（1752～64）に雲州の神官門脇好井がこれを見て、 この宮におけば火災盗難の恐れあり、出雲大社に保管するのが安全として持ち去った。その証として神器を模写した三幅を寄進した。」という伝承を載せているが、文政の火災により写幅は現存しない。

社家の長尾氏は現宮司で五十代に及ぶ。