創立年代不詳。往古より高國大明神と称し眼角郷四村（濁谷、門谷、秋縄、三土）の産土神である。往古は2石4斗7升1合の社領があったという。（『伯耆志』）明治元年高圀社と改め、同6年高圀神社と改称した。大正2年に濁谷の大平神社（月読命）と高山神社（素盞嗚命）を合併。同4年濁谷の濁谷神社（もと國司大明神大國主命外7神）、三土の山口神社（大山祇命外2神）、門谷の門谷神社（もと國司大明神大國主命外4神）を合併した。