創立年代は不明である。昔、地中に光る玉を発見した村人たちが、その地に社殿を建立し、産土神として奉斎倉智神社したのが起源と伝わる。近世まで倉智（蔵地）大明神と称した。明治初年に倉知神社と改称。大正9年に藤森神社に合併されたが、戦後分離してもとの社地に祀っている。