古くより姫大明神と称する高住村の氏神である。『鳥取縣神社誌』は古老の伝を引いて元和9年（1623）の創立としている。

現存する棟札に「宝暦四（1754）年十一月　奉建立姫大明神一宇成就」とある。

明治元年、高住社と改称。後に高住神社と改称した。