創立年代は詳らかでない。往古より妙見大明神と称した。

明治元年（1868）に境内の稲荷大明神（保食神）と湯坂の瀧大明神（罔象女命）を合祀し、同5年に中村神社と改称した。

水根部落の一部が氏子である。