往古は牛頭天王と称していた。創立年月は不詳であるが、寛永15年（1638）、神祇官領長の『裁許状』に牛頭天王と記されている。

明治初年、富吉神社と改称した。

祭神の大山咋命は古く村内字三反田に鎮座し松尾神と称し、当社の摂社であった。

又、倉稲魂神は稲荷大明神と称し当社境内末社であったが、共に明治元年、当社に合祀された。