創立年代不詳。古くより山王大明神と称する。以前は64石8斗9升の社領があったと伝わる。当時神饌供物を洗った井筒として、御水井土、洗度井土、研井土の三所があって今も残る。

その後、社領は減少し、慶長6年（1605）、中村伯耆守より神主居屋敷手作分として3石を附され、慶長16年（1611）米子城主加藤氏及び元和4年（1618）藩主池田氏よりも中村氏と同じく取り扱われ、寛文7年（1667）社領1石8斗9升9合を先規により寄進されている。

明治初年に地名（犬田庄奥陰田村）に因んで犬田神社と改称した。この時、村内の摂社衣那荒神（木花咲屋姫命）、高良社（武内宿禰命）、天満天神（道真公）と鷺大明神（稲背脛命）を合祀した。