創立年代不詳。出雲国神門郡日御碕神社の御分霊を勧請したと伝わる。

嘉永3年（1850）の社帳には日御嵜大神宮と記されており天長年中（824～34）の勧請とある。

明治初年に村内摂社熊野神社（速玉男命　事解男命）を合祀して日御碕神社と改称した。