本文創立年代不詳。祭神は熊野本宮大社より天文4年（1536）に勧請されたと古文書にある。近世、本宮大明神と称されたが、明治初年に本宮神社と改称した。大正2年に宇田川神社に合併されたが、遠隔地のため昭和25年に復興。本宮部落の氏神である。

当社は昔から水の神様として信仰厚く、干魃時も渇れる事なく湧き水が流出し「本宮の泉」として、町民の飲料水、潅漑水として利用されている。太古はこのあたり迄が海岸で、幾百の古墳が残っている。