元禄７年（1694）に播磨国廣峰牛頭天王の分霊を勧請したと伝わる。安政５年（1858）に本殿再建。近世まで牛頭天王と称したが、明治５年に毛谷神社と改称した。大正１０年５月毛谷坂清水の清水神社（保食神）を合祀した。