成務天皇の御代武内宿禰當国に下向し社殿を建立し自ら此神を祀るとの社伝がある。

近世まで隼二五社大明神と称した。仁和4年（888）社殿を建立。

天正10年（1582）8月羽柴秀吉の爲に兵火にかかる。慶長10年（1605）社殿を再建し、福井、見槻中、郡家の3ヶ村の氏神とする。

寛文10年（1670） 社殿造営。文化13年（1817）社殿造営（現在の本殿）。

明治元年隼社と改め、明治6年隼神社と改称した。近隣の若桜鉄道の駅名と大型単車「隼」の名称が同じ事から、全国から 「隼」のオーナーが当地域に集い、その関係者の参拝が多い。