創立年代不詳。日下部の下部落の氏神で近世まで八幡宮と称した。

古老の伝に当村東南方に八幡代と言う字があり、旧社地の跡という。

中世村内に悪疫流行し死者多く、八幡宮を崇敬して現社地に移祭したと伝わる。

明治元年に日下部社と称し、明治6年に日下部神社と改称した。