創立年代不詳。近世、日高見大明神と称した。

『旧神社誌』に、「口碑によるに往古悪疫流行し爲に土人の死する者多し。此に於て伊蘇乃佐只神社神主春菜某霊畤を裏伊丹の地に設け天祖を祀りて祈願せしが、土人その霊験を渇仰して社殿を造営せりと伝ふ」とある。

明治元年に日高見社と改め、同6年12月に日高見神社と改称した。