創立年代不詳。往古より三浦大明神と称した。

三浦、岩渕、柿原の三ヶ村の氏神であったことから、三村大明神とも称した。

『旧神社誌』に「古く老婆城の守護神にして城主の一族郎党たる保木本、尾崎、三浦、会見等の崇敬篤しと云ふ」とある。

明治元年三浦社と改め、同6年12月三浦神社と改称した。

令和２年上山神社を合併。令和６年に清常神社、小松神社、保木本神社を合併した。小松神社、保木本神社のご祭神は清常神社に合祀され、清常神社は三浦神社の境外社となった。