創立年代不詳。往古より上津黒村の氏神で、近世文献にはタテカウ大明神の表記もみられる。

天正9年（1581）羽柴秀吉が入国し市場城攻略に際し兵火により社殿が焼失。

後に約200ｍ奥に社地を設け小社を建て再興。次いで宝永4年（1707）と安永8年（1779）に社殿を改築。

明治元年に多智原社と改め、同6年に多智原神社と改称した。