創立年代不詳。大坪村の氏神で近世まで諸木大明神（句句迺馳命）と称した。

往古は字諸木に鎮座していた。当地の領主大坪甚兵衛一之が崇敬していたが、天正9年（1581）羽柴秀吉入国に際し大坪氏は滅亡、本殿その他社殿は兵火により焼失した。

その後、仮殿を建立したが承応2年（1653）の洪水で流失。しばらく社殿を建立せず摂社大木の神を崇敬していた。

天和4年（16894）4月に再興した。明治元年に摂社（句々逎馳命）と稲荷大明神（倉稲魂命）を合祭して諸木社と改め、同6年に諸木神社と改称した。同12年に社殿を改築した。

大正元年9月に下私都村の貴布禰神社、山上神社、高峰神社、山田社、山路神社、花原神社と荒神社を合祭し私都神社と改称。戦後、合併七社は分離した。