『延喜式』神名帳（927）に「恩志呂神社」と所載され、『因幡國民部省圖帳』（1322）に「恩志呂大明神寛治二年（1088）戊辰十一月依小野篁之私願自宇佐宮郷遷座也」と記されている。

『鳥取縣神社誌』は、社記によればとして「天武天皇白鳳四年（674）奉幣勅使有り云々」と記し、本使・副使の下向、金銭奉納等の伝承を述べている。

近世は武王大明神と称したが、明治初年に恩志呂神社と改称した。