勧請年代不詳。古くは荒神と称し、文亀・永正（1501～21）の頃、高岡の牛頭天王（高岡神社）の神幸神事の御旅所と云われる。

明治元年（1868）麻生社、同7年3月麻生神社と改称。

大正7年に高岡神社に合併され、境内末社稲荷神社（保食神）も高岡神社境内社として移転されたが、昭和25年6月に分離、元の社地に上麻生神社、上麻生稲荷神社（末社） として再興した。