創立年代不詳。古くは牛頭天王と称した。

荒木山の深い森を切り開いて日光を差し込むようにしたことから村名を光好（光吉）と呼んだとする伝承もある。

近くに御手洗川（宮井手）があり、貞享2年（1685）の洪水で社殿宝物等悉く漂流、御神体も危うくなったので、奉仕神官の池田治部が激流の中を背負って帰り、当時の西邸の地に仮殿を造って安置した。

その後神託により、同年8月に今の地に奉遷したと伝えられる。明治元年長田社と改称、同6年に長田神社と改称した。