創立年代不詳であるが、口伝によると葛下庄筒地に、当地開 拓の昔、大國主命の霊験があったので祭神として奉斎したと伝えられる。

大永年中（1521～28）尼子氏の為に兵火にあい旧記、神宝を失う が、後に藩主より再興を命じられ、1石2升の神饌を下賜されている。 それ以来、年4度（3月3日・5月5日・9月29日・11月8日）祭典を執行、武運長久の祈願をしていた。（祈願神札を藩主に上る古例がある。）

しかしながら北福村は八重垣、外垣、内垣等の小字を有し、上代の旧跡を残す由緒ある地であるとして、寛永16年（1639）漆原村助右門、大成の五左衛門、原村七左衛門の3名を本願とし、舎人の庄北方村字宮越（現社地）に奉遷した。

近世まで国主大明神と称したが、明治初年に北方神社と改称。明治30年に國主神社と改称した。大正2年舎人村漆原の 新宮神社（もと新宮大明神伊邪那美 命）と方地の小林神社（もと伊勢宮 天照皇大神）を合併。

大正3年9月野方の村社野方神社（もと三宝荒神須佐之男命）と白石の村社白石神社（も と松尾大明神須佐之男命）を合併した。野方区、白石区、方地区、漆 原区、北福区の氏神である  。