創立年代不詳。往古に紀州熊野より勧請し、近世まで新宮大明神と称した。

明治初年に当村瀧谷の山ノ神（大山祇命）と境内鎮座稲荷大明神（保食神）、 瀧宮の岩瀧神（罔象女命）を合祀し、長瀨神社と改称した。長瀬の氏神である。