創立年代不詳。

慶長13年（1608）、池田備中守長吉（鳥取藩主の祖池田輝政の弟）の代官木瀬藤右衛門が当地に滞在の節、当社祈願に依り子宝に恵まれ、報恩の証として本社を再建したと言われている。

宝永6年（1709）に社殿を再建。古くより山王大明神と称されていた。 

明治初年に境内末社稲生大明神（保食神）を合祀し中井神社と改称された。中井部落の氏神である。