創立年代不詳。明治初年に往古よりの産土神、天日神大明神（天穂日命） と湯谷字東大滝の瀧神（瀬織津姫命）とトキ山の稲荷大明神（保食神）の三社を瀧神の社地に合祀して湯谷神社と改称した。

平成6年から同11年にかけて石鳥居改建、 狛犬奉献、参籠所の改造等、境内整備事業を遂行した。湯谷部落の氏神である。