『延喜式』神名帳（927）に「志加奴神社」と記載される名神小社である。近世まで、勝島大明神（志加奴神社勝島大明神）と称した。

『因幡誌』は亀井茲矩が鹿奴在城の時、当社地が城山から見下ろす位置にあったので、「柄杓目」（芦が谷）の地に奉遷し、後にまた現社地に奉遷したと記しているが、諸資料（『裁許状』、『神社明細帳』、口碑）によると、中古に鹿野村（鍛冶町）から同村ヒシャクメに移り、中世は宿村宮山ノ奥に転じ、その後現社地に移転したことがうかがえる。社地の移転は水谷川の氾濫、被災によるものと思われ、亀井氏在城はその後のことである。

武門の崇敬が篤く、慶長16年（1611）、領主亀井家より社領田1町歩が寄進された。

寛永10年（1633）、藩主池田家から社領石高16石4斗5升の寄進と共に、家紋である揚羽蝶を社紋として許可された。

明治元年（1868）に勝島大明神の社号を廃し、境内末社稲荷神（保食神）を合祭して志加奴神社と改称した。

大正5年、鹿野町の青木神社（もと青木大明神須佐之男尊）を合祀した。

境内末社上坂神社は、大正5年に二本木の小林神社（もと妙見）、重高の樽間神社（もと大宮大明神）、土居の山崎神社（もと山王）を合祀して一社を創立したものである。古鐘（元禄3年改鋳）があり、大東亜戦争中供出したが、戦後返還された。昭和39年、鐘楼を建立した。