起源は不詳であるが、もと恵比須と称し夏泊地区の崇敬神社である。

明治初年、潮津神社に合併の指導があったが、漁業関係者の反対により、合併を免れ、現社名に改称した。

最も古い棟札は、元禄12年（1699）「奉造立蛭児尊神殿一宇」がある。

天保12年（1842）作の狛犬と弘化4年（1847）作の鳥居は、共に石工川六の作。