創立年月不詳。往古より八幡宮（郷社八幡神社）の摂社で日御崎大明神と称していたが、明治初年に現在の社号に改めた。この時、境内末社（素盞嗚尊）を合祀した。文政１０年（１８２８）製作の社号額には「日御崎太神宮」と刻まれている。