元和９年(１６２３)に、当村黒正家の祖先五右衛門が出雲の日御﨑神社より勧請したと伝えられる。元禄８年(１６９５)４月の棟札には、「奉修復御碕大明神」、安政の『神社改帳』には「日御碕大明神」とある。吉長の産土神として崇敬され、八幡宮（八幡神社）の摂社に定められた。明治初年に吉長字北田の稲荷大明神（倉稲魂命　明和３年（１７６６）の棟札現存）を合祀して、現在の社号に改めた。３８枚の棟札が現存する。