創立年代は不明である。もと山ノ神（慶応4年（1868）の神社書上帳には山神大明神社とある）と称していたが、 明治初年に境内末社御崎大神宮（美佐佐伎命）を合祭して山口社と改め、同6年山口神社と改称した。