創建年月不詳。

古くより松上大明神と称し、山根地区の氏神として崇敬されてきた。

明治初年に、末社の稲荷大明神（倉稲魂神）を合祀し、山根神社 と改称したが、昭和15年11月に古称を重んじて松上神社と改称した。