創立年代不明。

往古、山城国男山八幡宮（石清水）の分霊を勧請したと伝えられている。

近世まで正八幡宮と称した。明治初年に穴窪神社と改称されたが、昭和13年4月に八幡神社と改称した。

穴窪地区の氏神である。