創立年月不詳。『因幡民談記』（1671）には「矢萩（氏神）妙見」とある。

明和2年（1765）10月の本殿建立の棟札が現存する。

嘉永元年（1848）の『神社改帳』 には妙見大明神と記載されている。

明治初年に矢矯神社と改称。大正2年に洞谷の洞谷神社（もと荒神素戔嗚神）、瀬田蔵の瀬田倉神社（もと瀬田倉大明神素戔嗚命）、妙徳寺の松上神社（もと松上大明神國常立命）、矢矯の香取神社（もと香取大明神また柁大明神經津主神少彦名神大巳貴神）、双六原の桑田神社（もと荒神素戔嗚命） を合併した。

昭和20年代に香取神社と桑田神社以外は分離した。

昭和39年に本殿・幣殿・拝殿を建立した。

現在合祀されている香取神社は、往古毛無山山麓の巨石（柁岩―かんどりいわ）が並ぶ通称狼谷に鎮座し、その使いは狼とされ、神札には狼が写されている。

又、口碑に付近の古道（せんずがたわ）を大国主命が通ったと伝わる。