『日本三代實録』巻14貞観9年 （867）5月の条に「以因幡国正三位天穂日命神列於官社」と記されている。当時の神階としては因伯両国の最上位である。

『延喜式』神名帳（927）にも所載の神社である。

永禄4年（1561）、岡谷・小辛川・長谷 ・湯戸・荒船の5社を合祀、以来六王と称した。

天正12年（1584）、秀吉の因幡攻めの折、社殿他一切を焼失。

『稲葉民談記』他、近世諸資料には「六王大明神」とあり、『因幡誌』所載の当神社図に見える鳥居額には「六王神社天穂日命」とある。

明治初年、旧称（現社名）に復した。

大正2年に村内荒船神社（熊野久須毘命）と稲荷神社（保食命）を合祀した。大正7年、本殿を建立した。